Lyra je siroče koje živi u paralelnom univerzumu gde su nauka, teologija i magija isprepleteni. Njena potraga za otetim prijateljem otkriva zlokobnu zaveru koja uključuje ukradenu decu i pretvara se u potragu za razumevanjem misterioznog fenomena zvanog Prah. Kasnije joj se na putovanju pridružuje Vil, dečak koji poseduje nož kojim može da iseče prozore između svetova. Dok saznaje istinu o svojim roditeljima i svojoj proročkoj sudbini, njih dvoje bivaju uvučeni u rat protiv nebeskih sila koji se proteže kroz mnoge svetove.